Bij manuele verwijdering wordt een nest handmatig verwijderd door een professionele bestrijder. Met een hoogtewerker of al klimmend bereikt de aannemer de nesten. Sommigen verlijmen het nest eerst en steken het dan af. Anderen verwijderen het nest met een zak rond hun hand, zo belandt het nest in de zak. Net als bij het zuigen, moeten ook hier de weggehaalde nesten worden afgevoerd naar een erkend afvalverwerkingsbedrijf.